يتحكم لاعبو Ragdoll Ninja في تحريك الشخصية الرسومية كاتانا، والتي تسعى إلى تدمير دمى النينجا المعادية لها عبر المستويات المختلفة، حيث يتم الأمر بطريقةٍ بسيطةٍ للغاية، فلا يحتاج اللاعب لأكثر من إصبعٍ واحدٍ لتحريك شخصيته نحو الأمام، والقيام ببعض الحركات البهلوانية واستخدام سيف النينجا لقتل الدمى المؤذية.
ومع تقدّم اللعب، سيزداد تعقيد المستويات ضمن اللعبة، فيصبح اللاعب مضطراً للطيران بأقصى سرعةٍ ممكنةٍ ومن طرفٍ إلى آخر، محاولاً إنهاء حياة الدمى التي تهاجمه في كل مكان والحفاظ على حياته لمواصلة اللعب.
