تحيط هذه اللعبة بمجموعةٍ من شخصيات المانجا Shōnen Jump، والتي يمكن التحكم بها والقيام بالنشاطات الحماسية متعددة اللاعبين وذلك برفقة كلاً من Midoriya، Todoroki، Bakugo وغيرهم الكثير.
حيث تبدأ رحلتنا في اللعبة The Strongest Hero بشكلٍ مشابهٍ جداً لما كان يحدث في قصة الكرتون الأساسية فتكون المواجهات مصيريةُ ما بين Might و Deku، لننتقل بعد ذلك إلى التجوّل في مدينة Musutafu فنقوم بالمهام المختلفة التي يشار إلينا بها من قبل الأكاديمية، بحيث يطلب منّا التخلّص من كافة الأشرار الذين يريدون العبث وإحداث الفوضى في المدينة.
كما تتشابه آلية التحكم في هذه اللعبة مع غيرها من ألعاب تقمّص الشخصيات ARPG، إذ يمكننا تحريك الشخصية باستخدام عصا التحريك الافتراضية على يسار الشاشة، بينما تتركّز نشاطات الهجوم في أزرار الجهة اليمنى، علماً أن هذه النشاطات ستختلف من شخصيةٍ إلى أخرى، فلكلٍّ منها إمكانياته المختلفة عن بقية الشخصيات، إلا أننا لن نقود شخصيةً واحدةً فقط أثناء اللعب، وإنما يتطلب الأمر منا أن نتعامل مع المهام الموكلة إلينا من خلال العديد من الشخصيات وبالتالي ستكون لدينا القدرة على التحكم في ثلاث شخصياتٍ كحدٍّ أقصى ضمن كل مهمة.
وتدعم اللعبة My Hero Academia: The Strongest Hero نظام التجنيد Gacha، والذي يمكننا استخدامه لإضافة الكثير من الأبطال إلى فريقنا الخاص، وإن كنا نمتلكهم بالفعل سيكون بوسعنا تعزيز طاقاتهم وقدراتهم، وهذا ما يمنحهم فرصةً أقوى لهزيمة الأعداء، كما نستطيع تحسين مهاراتهم وخصائصهم أيضاً، وذلك باستخدام العديد من الكائنات التي سنحصل عليها أثناء قيامنا بالمهام أو كجائزةٍ نكتسبها من خلال الوصول إلى بعض الأهداف.